Predicción de epítopos en la proteína DR-7 que codifica un fragmento del gen Omp de Candidatus Liberibacter asiaticus


Citation
Quibrera et al. (2024). Brazilian Journal of Animal and Environmental Research 7 (3)
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Abstract
Debido a la rápida diseminación de la enfermedad más devastadora de los cítricos a nivel mundial conocida como Huanglongbing (HLB), es necesario desarrollar tecnologías alternativas para su diagnóstico oportuno. En este trabajo se realizó la predicción de epítopos en la proteína DR-7, localizada en la membrana externa de la bacteria Candidatus Liberibacter asiaticus que afecta al limón Mexicano, la cual fue caracterizada con capacidad antigénica. Mediante el uso de la base de datos IEDB Analysis Resource y utilizando los métodos Bepipred Predicción de Epítopos Lineales y Escala de antigenicidad de Kolaskar y Tongaonkar epítopos, se identificaron 24 epítopos en la proteína. Con la base de datos Inmune Epitope and Analysis Resource se seleccionaron siete de estos epítopos validados experimentalmente. Además, la proteína DR-7, presentó un 91% de antigenicidad en la Escala de Kolaskar y Tongaonkar, lo cual la constituye como un excelente candidato para el desarrollo de un método de diagnóstico temprano del HLB.
Authors
Publication date
2024-08-06
DOI
10.34188/bjaerv7n3-037

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