En Montecillo Texcoco, Estado de México se observaron plantas de margarita (<em>Dimorphotheca</em> <em>sinuata</em>) exhibiendo síntomas de filodia, virescencia y proliferación de ramas axilares putativos a los inducidos por fitoplasmas. Por lo que el objetivo de esta investigación fue detectar el fitoplasma asociado a estos síntomas mediante PCR con los iniciadores P1/P7 y R16F2n/R2. Se detectó la presencia de fitoplasmas en tejido foliar sintomático. El producto de PCR de 1200 pb obtenido de la PCR se secuenció y sometió a digestión con las enzimas de restricción MseI (Tru91), AluI, Kpn1 y HaIII, los patrones de restricción evidenciaron que el fitoplasma presente en <em>Dimorphotheca</em> <em>sinuata</em> es <em>Candidatus</em> phytoplasma asteris (16SrI). Las secuencias obtenidas fueron depositadas en la base de datos del NCBI y tuvieron una similitud del 99% con <em>Candidatus</em> phytoplasm asteris grupo 16Sr1-B de Irán (MH638316.1). Se realizó un análisis filogenético con el método de Neighbour-Joining, en el cual el aislamiento detectado en margarita, se agrupó con <em>Candidatus</em> phytoplasma asteris. De acuerdo con los síntomas observados en campo, análisis de patrones de restricción, secuenciación y filogenia, indican que la filodia en margarita está asociada a <em>Candidatus</em> phytoplasma asteris, relacionado filogenéticamente al grupo 16Sr1-B.